强直性脊柱炎的大部分患者患有关节疾病，其中大部分患者首次侵害骶髂关节，然后累及颈椎。具体关节病变如下：
骶髂关节炎：约90强直性脊柱炎病人最先表现为骶髂关节炎。到颈椎的进展后，反复腰痛，腰骶部僵硬感，间歇性或交替的腰痛和髋关节疼痛两侧的性能可放射至大腿，无阳性体征，直腿抬高试验阴性。不过，按下或简单的伸展骶髂关节可引起疼痛，所以不像坐骨神经痛。有些患者没有症状骶髂关节炎，只有X射线律师发现异常。约3宫颈强直性脊柱炎的早期参与，向下的进展至腰骶部后，7周脊柱若干段强直性脊柱炎同时参与。
腰椎间盘突出症：累及腰椎时，多表现为腰背下段、前段及腰椎活动受限。腰椎屈曲、屈曲、侧弯和旋转都是有限的。体格检查可发现腰椎突压痛、椎旁肌痉挛、晚期腰肌萎缩。
胸椎：当涉及胸椎时，会表现出背痛、前胸和侧胸痛，最常见的是驼背畸形。例如，当肋椎关节、胸骨柄关节、胸骨锁骨关节、肋间软骨关节受影响时，胸痛呈带状，胸部扩张受限，而当吸入、咳嗽或打喷嚏时，胸部疼痛加重。重症患者的胸骨维持在召唤状态，胸部扩张程度比正常人低50%以上，因此只能靠腹部呼吸辅助。由于胸腔和腹腔容量的降低，导致了心肺功能和消化功能障碍。